Le travail de Goigoux est remarquable même si les lenteurs des procédures de publication universitaire ralentissent considérablement ses productions.
Mais au fond, c'est bien superflu tout ça... Non? 
Première constatation : étudions un peu les objectifs visés (les champs ciblés par l'outil!) ; 
" 1. Les connecteurs
 Ce sont des mots appartenant principalement à trois catégories syntaxiques : • les conjonctions et locutions conjonctives • les prépositions et locutions prépositionnelles • les adverbes et locutions adverbiales Ils établissent, entre les éléments reliés, une relation logique et une nuance de sens précise (opposition, cause, conséquence, temps, condition, comparaison, but, ...).
2. Les substituts
Ils appartiennent à 2 catégories : • les substituts grammaticaux : pronoms personnels, possessifs, démonstratifs, numéraux et cardinaux, interrogatifs et relatifs. • les substituts lexicaux : un synonyme, une périphrase, un mot générique, un mot de la même famille, un mot qui résume…
3. Les inférences
Faire une inférence, c’est effectuer des liens entre les propositions, entre les phrases d’un texte ou d’un paragraphe ; c’est raisonner pour trouver/comprendre une information qui n'est pas écrite dans le texte. 4. Les marques morphosyntaxiques
 Reconnaître les marques morphosyntaxiques, c’est repérer les indices de genre, nombre, personne, temps verbaux pour effectuer les bons regroupements nécessaires à la compréhension.
5. Les idées essentielles
 Retrouver les idées essentielles, c’est saisir le sens global d’un texte ou d’un paragraphe pour se construire une image mentale de la situation.
6.Les hypothèses
 Une hypothèse  est une proposition ou une explication que l'on énonce sans l'affirmer ou la nier. Elle peut être étudiée, confrontée, utilisée, discutée par le groupe de lecteurs."

Excusez-moi mais tout ça ressemble fichtrement à un programme de GRAMMAIRE... Une matière qu'on a longtemps dénigré au motif qu'elle était par trop absconse ou rébarbative! Retour en grâce donc, mais comme toujours par l'artifice de l'ellipse, de la paraphrase ou l'art de la synonymie très en vogue dans les arcanes ministérielles. En dehors de pistes assez spécifiques à la lecture comme les inférences et les hypothèses, on se situe bien dans le domaine de l'étude de la langue. Me trompé-je?

Deuxième remarque : 
"septembre octobre = préparation et évaluation diagnostique
Novembre à juin (moins 6 semaines de congés) = trois modules de travail
Juin = évaluation finale"

Et voilà la pédagogie  nouvelle : 30 à 40% du temps scolaire consacré à l'évaluation!!! Se rendra compte un jour que les heures scolaires sont trop coûteuses et précieuses pour qu'on passe un tiers de son temps à prendre des mesures. Enseignons, enseignons! On ne progresse pas en sport avec un chronomètre, on ne guérit personne avec un thermomètre. 

C'est navrant tout ça. Néanmoins, le travail proposé est sérieux et bien conçu. Sans doute utile!!!
 Il faut juste arrêter d'essayer de nous faire prendre des vessies pour des lanternes et appeler un chat un chat.